Auf der Ikarus-Basis, einer streng geheimen Forschungseinrichtung auf einem fremden Planeten, arbeitet eine Einsatzgruppe aus Wissenschaftlern und Soldaten unter dem Kommando von Colonel Everett Young (Louis Ferreira) an der Entschlüsselung des neunten Chevrons. Doch ausgerechnet während dem Besuch eines Senators wird die Basisstation angegriffen und überrannt. Colonel Everett Young (Louis Ferreira) veranlasst daraufhin die Evakuierung der Ikarus-Basis durch das Stargate und dem Team gelingt die Flucht an Bord des unbemannten Raumschiffes Destiny, das auf festgelegtem Kurs das Universum erkundet. Somit sitzen die Flüchtlinge in ihrem "Rettungsraumschiff" fest und landen nicht wie geplant auf der Erde... Mit "Stargate Universe" gelingt den Produzenten bereits das zweite erfolgreiche Spin-off der Kultserie "Stargate"!